Une étude menée au Cameroun entre décembre 2022 et mars 2023 a identifié les sous-variants du SARS-CoV-2 en circulation lors d’une légère résurgence des cas de COVID-19. Sur 737 personnes testées, 42 étaient positives, et 13 échantillons ont été séquencés avec succès. Les variants détectés incluaient BA.5 (3 cas), BQ.1.1 (4 cas), XBB.1 (4 cas) et deux recombinants atypiques BA.4.6/XBB.1, tous associés à des symptômes grippaux légers.
La majorité des cas séquencés concernaient des femmes (70%), avec un âge moyen de 34 ans, et 70% n’étaient pas vaccinés. Les charges virales étaient élevées, avec une valeur médiane de Ct de 22,23 pour le gène N et 24,09 pour le gène ORF. Les symptômes les plus fréquents comprenaient des maux de tête (7 cas), de la fièvre (6 cas) et de la toux (4 cas), reflétant la faible sévérité des infections.
L’étude souligne l’importance de la surveillance génomique pour suivre l’émergence de nouveaux variants, notamment les recombinants BA.4.6/XBB.1, qui pourraient influencer la transmission et l’efficacité des vaccins. Bien que les symptômes soient bénins, la circulation de ces variants nécessite une vigilance accrue pour prévenir de futures vagues épidémiques.